警惕的需要:新的变异和疫苗的突破

一年多前,世界卫生组织正式宣布COVID-19大流行。112个月后,我们见证了FDA紧急使用授权的开发和发布两种新型RNA疫苗一种腺病毒载体疫苗2 - 4这引发了疫苗接种工作,截至2021年5月20日,美国已注射了2.75亿剂疫苗。5

在新冠肺炎疫苗有效性的支撑下,疫苗接种率的成功促使CDC放松了口罩指导6以及各州重新开放。然而,鉴于出现突破性感染的可能性——完全接种疫苗的人仍然会感染sars - cov -2——重要的是要记住,疫苗不是一颗银弹,仍然需要谨慎。

洛克菲勒大学(Rockefeller University)在常规筛查后,最近发现了两例此类突破性感染。在最近的一份出版物中,7研究人员使用靶向RNA-Seq面板对这些病例进行了更深入的研究,并检查了潜在的临床显著变异。

警戒标识的突破

洛克菲勒大学从2020年秋季开始对所有员工和学生进行基于唾液的SARS-CoV-2 qPCR检测。今年早些时候,他们监测了417名完成Moderna或辉瑞生物技术(Pfizer-BioNTech)疫苗疗程(定义为至少在试验前两周接受第二剂)的人和1491名未接种者的测试。

通过这种筛查工作,洛克菲勒大学确认了两名SARS-CoV-2检测呈阳性的有症状者。两个人都没有任何严重COVID-19的风险因素。患者1,一名51岁妇女,接受了Moderna疫苗;患者2,一名65岁的妇女,接受了辉瑞生物技术公司的疫苗。

考虑到这些不寻常的病史,研究人员选择对这两名患者进行靶向RNA测序亚博yabo77vip安捷伦确定选择CD Pan人类冠状病毒专家组8该小组包括的探针不仅针对SARS-CoV-2,而且针对所有人类冠状病毒。

泛人类冠状病毒小组是为应对COVID-19大流行而设计的,由伦敦大学学院病原体基因组学部门主任、英国COVID-19基因组学联盟成员朱迪思·布鲁尔教授设计。更多关于这个面板的信息以及在病原体基因组学中使用靶向NGS的好处可以在我们的之前的文章

打破突破

利用sureelect CD Pan人类冠状病毒面板,研究人员确定了具有潜在临床意义的多个突变。这两名患者都携带了D614G突变的变体,但只有1名患者携带了E484K突变的变体——此前已证明该突变可提供对中和抗体的抗性。9,10通过对患者1的变异进行进一步分析,研究人员能够确定患者1中发现的变异与B.1.526(纽约)和B.1.1.7(英国)变异有关,但又不同。

警惕的需要:新的变异和疫苗的突破

确保一个响应

为了提供证据证明这是一个真正的突破,而不是对疫苗缺乏反应,研究人员使用了伪中和试验。50%中和试验效价(NT50)在感染后1.3个月接种疫苗者和未接种疫苗者显著升高(NT50= 451和401),而未接种疫苗的人在感染6.2个月后(NT50= 78)。然而,在患者1接种后和感染后(NT .)观察到极高的中和抗体滴度50= 3,209)与疫苗诱导的抗体反应一致。

考虑到之前观察到的E484K突变体产生的抗体抗性以及与纽约突变体的相似性,9,10研究人员询问患者1的抗体是否能够识别这些变体。NT50值在野生型、E484K变异株和纽约变异株之间没有显著差异,这表明虽然疫苗反应足以识别被测试的变异株,但不足以防止后续感染。

讨论

今后,识别能够逃避疫苗保护的SARS-CoV-2变种将是至关重要的,以便我们能够监测它们的传播,并可能制造针对它们的疫苗。尽管这是一个不受欢迎的消息,但作者指出,这些发现并没有降低美国正在进行的疫苗接种工作的重要性。

洛克菲勒大学Heilbrunn教授和高级医师Robert B. Darnell博士说:“鉴于该病毒已被证明有能力在临床上进化出与变异相关的病毒,目前仍有必要对其进行识别,以减轻疾病传播和相关发病率。”

这些发现,特别是根据最近修订的CDC口罩指南,6强调在我们继续战胜这一流行病并努力最终战胜它的过程中,有必要保持警惕。


引用:

  1. 世卫组织总干事2020年3月11日在2019冠状病毒病(COVID-19)疫情媒体通报会上的讲话https://www.who.int/director-general/speeches/detail/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19---11-march-2020(2021年5月25日)。
  2. 专员公署。Pfizer-BioNTech COVID-19疫苗https://www.fda.gov/emergency-preparedness-and-response/coronavirus-disease-2019-covid-19/pfizer-biontech-covid-19-vaccine(2021年5月25日生效)。
  3. 专员公署。现代化COVID-19疫苗https://www.fda.gov/emergency-preparedness-and-response/coronavirus-disease-2019-covid-19/moderna-covid-19-vaccine(2021年5月25日生效)。
  4. 专员公署。詹森COVID-19疫苗https://www.fda.gov/emergency-preparedness-and-response/coronavirus-disease-2019-covid-19/janssen-covid-19-vaccine(2021年5月25日生效)。
  5. 疾病预防控制中心。COVID数据跟踪https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/(访问2021年5月25日)。
  6. 疾病预防控制中心。COVID-19与您的健康https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/prevent-getting-sick/cloth-face-cover-guidance.html(访问日期:2021年5月25日)。
  7. Hacisuleyman大肠;黑尔,c;斋藤,y;Blachere:大肠;马瑞医生,m;康伦,e . g .;Schaefer-Babajew, d . j .;达席尔瓦,j .;Muecksch f;Gaebler c; Lifton, R.; Nussenzweig, M. C.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, P. D.; Darnell, R. B. Vaccine Breakthrough Infections with SARS-CoV-2 Variants. N. Engl. J. Med. 2021, No. NEJMoa2105000.https://doi.org/10.1056/NEJMoa2105000
  8. 亚博yabo77vip安捷伦没有对这个面板进行验证和验证。仅供研究用途。不用于诊断程序。
  9. 王,z;施密特,f;Weisblum y;Muecksch f;巴恩斯,c . o .;Finkin,美国;Schaefer-Babajew d;Cipolla m;Gaebler c;利伯曼,j . a; Oliveira, T. Y.; Yang, Z.; Abernathy, M. E.; Huey-Tubman, K. E.; Hurley, A.; Turroja, M.; West, K. A.; Gordon, K.; Millard, K. G.; Ramos, V.; Da Silva, J.; Xu, J.; Colbert, R. A.; Patel, R.; Dizon, J.; Unson-O'Brien, C.; Shimeliovich, I.; Gazumyan, A.; Caskey, M.; Bjorkman, P. J.; Casellas, R.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, P. D.; Nussenzweig, M. C. MRNA Vaccine-Elicited Antibodies to SARS-CoV-2 and Circulating Variants. Nature2021, 592(7855), 616-622。
  10. Weisblum y;施密特,f;张,f;达席尔瓦,j .;波斯顿d;Lorenzi, j . c;Muecksch f;Rutkowska m;霍夫曼,h。Michailidis大肠; Gaebler, C.; Agudelo, M.; Cho, A.; Wang, Z.; Gazumyan, A.; Cipolla, M.; Luchsinger, L.; Hillyer, C. D.; Caskey, M.; Robbiani, D. F.; Rice, C. M.; Nussenzweig, M. C.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, P. D. Escape from Neutralizing Antibodies by SARS-CoV-2 Spike Protein Variants. Elife20209。https://doi.org/10.7554/eLife.61312